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项目实操:糖尿病遗传风险预测
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课程介绍

一、项目背景

      糖尿病(DM)是一种以高血糖为特征的代谢性疾病,胰岛素分泌缺陷或其生物作用受损,都会引起高血糖。长期患有高血糖会导致各组织的慢性损害,引发功能障碍,对健康构成严重威胁。空腹条件下静脉血糖浓度正常参考值范围是 3.9~6.1mmol/L,若空腹静脉血糖浓度值大于 6.1mmol/L 或者糖后 2 小时大于 10.0mmol/L 可确诊为糖尿病。糖尿病存在家族发病倾向,25%~50%患者有糖尿病家族史。临床上至少有 60 种以上的遗传综合征可伴有糖尿病,分为 1 型糖尿病和 2型糖尿病,均存在明显的遗传异质性。 1 型糖尿病患者有多个 DNA 位点参与发病,其中与 HLA 抗原基因中 DQ 位点多态性关系最为密切,且存在免疫系统异常,在被某些病毒如柯萨奇病毒、风疹病毒、腮腺病毒等感染后会导致自身免疫反应,破坏胰岛素β细胞。 2 型糖尿病患者发现多种明确的基因突变,如胰岛素基因、胰岛素受体基因、葡萄糖激酶基因、线粒体基因等。进食过多,体力活动减少导致的肥胖是 2 型糖尿病最主要的因素,使具有 2 型糖尿病遗传易感性的个体容易发病。每年用于慢性疾病医疗费用占中国公共医疗卫生支出的比例超过 13%,心血管病、糖尿病等慢性疾病每年导致的死亡人数占总死亡人数的 80%。2017 年的第一份世卫组织《全球糖尿病报告》中显示,1980 年~2014 年期间,全球糖尿病患者数量从 1.08 亿增加到了 4.22 亿,其中成年人糖尿病患病率,从 4.7%增加到了 8.5%,中等收入和低收入国家的糖尿病患病率上升速度更快。

 

二、项目目标

     1. 通过体检数据,以血糖值为目标来建立相关的模型实现血糖预测。

     2. 预测糖尿病遗传风险并对预测结果进行分析。

      

 

三、实现工具

      Python3:NumPy、Pandas、Matplotlib、LightGBM 等。

 

注:本课程仅供在线实习班级使用。

授课教师

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